幾乎所有常用材料如鐵、鋼、不銹鋼、鋁及其合金、銅及其合金、鎳及其合金、鈦及其合金、非金屬材料（ 有機材料和無機材料 ） 都會發生微生物腐蝕。

    鋼鐵

    在厭氧條件下， 硫酸鹽還原菌（SRB）誘發的腐蝕在鋼鐵材料微生物腐蝕中占主導地位，SRB 的腐蝕機理主要有以下 3 種理論 : 陰極去極化、濃差電池、沉積物下酸腐蝕。鐵細菌能使二價鐵離子氧化成三價，并沉積于菌體內外 :

    2Fe（OH） 2 +H 2 O+1/2O 2 y 2 Fe（OH） 3 ，從而促進鐵的陽極溶解過程，且三價鐵離子可將硫化物進一步氧化成硫酸。鐵細菌常見于循環水和腐蝕垢中，有嘉氏鐵柄桿菌、鞘鐵細菌、纖毛細菌、多孢鐵細菌、球依細菌幾種。

    銅及其合金

    銅及銅合金由于具有良好的抗腐蝕性、機械加工性、優異的導熱導電性、易焊接和抗污性，經常用于海水管道系統和熱交換器。通常認為，亞銅離子對微生物是有毒的，銅及其合金不會發生微生物腐蝕或腐蝕情況很輕，但實際情況并非如此。 SRB會腐蝕銅及銅合金，腐蝕產物為一層厚厚的、沒有附著力的硫化銅或者六邊形硫化銅。SRB產生的硫化氫被認為是導致銅及其合金發生點蝕及應力腐蝕開裂的因素，產生的硫化氫導致疏松易剝落的腐蝕產物層CuS及CuS 1 +x的形成，點蝕發生在硫化銅膜脫落處。 另外，假單孢菌也可使銅及銅合金腐蝕。

    細菌粘附于金屬表面的體外大分子物質對液相中的銅離子有飽和鍵合作用，從而使體外大分子活性高的菌落與體外大分子活性低的鄰近區域形成濃差電池。

    鎳及其合金

    鎳 及 其 合 金 耐 MIC 的 能 力 較強，但也能產生嚴重的點蝕。合金400（UNS NO4400） 在氯離子穿透鈍化膜的地方易發生孔蝕和縫隙腐蝕。

    硫化物不僅能導致氧化層的改變還能引起它的破裂。39Wagner 等介紹了合金 400 易發生沉積物下的腐蝕和形成由細菌引起的氧濃差電池。

    Gouda 等試驗證明：暴露在波斯灣的合金 400 發生局部腐蝕，蝕孔在SRB 產生的沉積物下形成，鎳選擇性脫溶。據報道一核電廠在連續沉積物下合金 400 的熱交換管上發生的與合金脫溶有關的孔蝕狀況。嗜熱菌可使 Ni201 發生嚴重的腐蝕，在 20-80e 時，溫度越高腐蝕越嚴重；將無菌和有菌介質中的該合金實片偶合時，這種細菌可使試片產生 3.8LA/cm 2 的陽極性電流。含有假單孢的冷卻水中，蒙乃爾合金熱交換管發生嚴重點蝕，并呈現出明顯的晶間腐蝕，鎳被優先浸出而剩下海綿狀的富銅物質。

    鈦及其合金

    鈦是最耐微生物腐蝕的材料。在材料表面涂一層鈦或鈦合金能阻止適合SRB生長的厭氧條件的形成。這是由于鈦或鈦合金形成的厚度約5-20nm 的二氧化鈦薄膜有特別強的保護功能，它能在 pH 值為 2 和 100e溫度下保持完整。特別是在海水中使用 30 年以上的鈦及其合金材料的調查研究發現，它們是耐 MIC 的。

    在低于 100e 的溫度下，鈦不受鐵細菌、氧化硫細菌、SRB、產酸細菌、濃差電池、氯濃差電池及氫脆的破壞。在實驗室研究中，等在 SRB 和氧化硫細菌存在的情況下，在較低溫度 （23e） 和較高溫度 （70e） 都沒有觀察到二級鈦 （UNS R50400） 的任何腐蝕。

    有機材料

    對于天然有機物遭受微生物侵蝕而破壞是易理解的，因為這些物質組成的材料為微生物的生長提供了養料，也就是說為高分子化合物變成小的基本單位的分解，為細胞質的形成提供了基質和代謝能量。

    有機合成材料也會遭受微生物的破壞。聚酰亞胺會受到真菌的破壞，損壞材料在電子集成電路中的絕緣作用。塑料也會因微生物的腐蝕而侵害其結構和功能，在這種腐蝕過程中，微生物可能起到非常重要的作用。對于這種作用數十年前還不了解，甚至今天有關腐蝕教科書和手冊也少有詳細介紹。從管道附近土壤中分離的細菌純培養物能分解瀝青和含蠟管道涂層，也能分解去乙烯管道。20 世紀 60 年代蘇黎世克洛滕機場的電力系統的絕緣材料因真菌侵蝕而發生短路，被迫重新更換。德國一貨船的救生艇上所有海難發射設備的塑料絕緣體由于被真菌覆蓋而導電，以至發射裝置無法正常工作，導致海難。

    無機材料

    微生物能夠腐蝕破壞無機材料并在地質學上參與風化過程，在巖石風化過程中微生物所發揮的作用比迄今認為的要重要得多。SRB 釋放出的硫化氫能在空氣中氧化，生成硫的氧化物及硫酸，均會對無機材料產生腐蝕。真菌分泌的有機酸和微生物體外的多聚物對水泥和石料也有重要的破壞作用。20 世紀 70年代德國漢堡市廢水系統的混凝土管道因硫氧化菌引起的腐蝕而造成的維修費用高昂。德國一家大型電廠冷卻塔的內壁以及科隆大教堂的沙架因硝化作用使 pH 值下降而后破壞了粘結料， 進而發生沙化的情況。

    我國杭州閘口白塔 （ 建于公元 907年 ） 和杭州靈隱寺雙塔 （ 建于公元960 年 ） 的石灰巖上都有微生物生長和腐蝕的痕跡。 當空氣污染嚴重時，空氣中大量的硫化物和未完全燃燒的碳氫化合物吸附在無機材料的表面上，為微生物生長提供了更為有利的條件。