承擔973課題主要任務：承擔材料亞穩相、多相、微納多尺度組織結構對其腐蝕行為的影響機理研究，以及合金化設計在深海環境下多因素腐蝕鈍化成膜及表面膜再修復及其穩定性控制基礎理論。

　　學校設有2個博士后科研流動站（交通運輸工程、電氣工程），2個一級學科博士點（交通運輸工程、管理科學工程），17個二級學科博士點，13個一級學科碩士學位授權點，57個二級學科碩士學位授權點，5個專業學位碩士授權點，45個本科專業，12個高職專業。擁有9個省部級重點研究基地。現有1個國家重點（培育）學科，5個國家級特色專業，9個部市級重點學科，17個上海市本科教育高地。設有水上訓練中心，擁有萬噸級集裝箱教學實習船“育鋒”輪，新造世界最大4.8萬噸散貨教學實習船“育明”輪。
 

　　在2004年教育部本科教學工作水平評估和2006年教育部英語專業教學評估中獲得優秀。2013年，年度科技總經費達到3.0億元，獲一批國家級科研項目及部市級以上科技進步獎。

　　實行校院二級管理體制，現設有商船學院、交通運輸學院、經濟管理學院、物流工程學院（設中荷機電工程學院）、法學院、信息工程學院、外國語學院、海洋科學與工程學院、文理學院（設徐悲鴻藝術學院）、科學研究院等二級辦學部門。在20000余名全日制學生中，有本科生近17000余人，各類在校研究生3000余人。在1000余名專任教師中，有教授146名，具有博士學位的教師比例約50%.學校致力于培養國家航運業所需要的各級各類專門人才，已向全國港航企事業單位及政府部門輸送了大量畢業生，被譽為“高級航運人才的搖籃”。

　　學校與境外50余所姐妹院校建立了校際交流與合作關系，開展教師交流、合作辦學、合作科研、學生交換等。與聯合國國際海事組織、波羅的海國際航運公會、挪威船級社等國際知名航運組織/機構建立了密切聯系。自2010年起開設“國際班”,邀請美國、韓國、波蘭、俄羅斯、德國等國家航海院校的學生來校學習“航海技術”、“航運管理”等專業。2011年，經教育部批準，學校與加納中西非地區海事大學合作舉辦“物流管理”本科教育項目，并開始在非洲招生，這是上海市地方高校第一個頒發中國高校本科文憑的海外辦學項目。2012年，學校獲教育部批準正式成為“接受中國政府獎學金來華留學生院校”。