最新發布的2019自然指數年度榜單（Nature Index 2019 annual tables）顯示，美國、中國和德國位居國家排行前三位，中國科學院、哈佛大學和德國馬普學會則是機構排名前三位。根據調整后的2018年分數計量值（fractional count/FC），排名前十的國家中，只有中國和澳大利亞實現了科研產出的正增長。

自然指數數據顯示，有43家美國機構和17家中國機構躋身全球100強。其中，中國十家領先的科研機構為：中國科學院（第1），北京大學（第10），清華大學（第13），南京大學（第15），中國科學技術大學（第17），中國科學院大學（第24），浙江大學（第27），復旦大學（第34），上海交通大學（第41），南開大學（第51）。

在過去三年分數計量值（FC）值增幅最大的50家機構中，有43家中國機構，并且包攬了前10位，其中位居前五的是中國科學院大學、上海交通大學、清華大學、南京大學和四川大學。

化學依然是中國實力最強的學科。中國有五家機構躋身化學科研產出全球前十：中國科學院、南京大學、北京大學、清華大學和中國科學技術大學。中國科學院在化學、物理學、地球和環境科學這三個自然科學學科的高質量科研產出均居全球第一位。

為衡量一家機構已發表高質量科研論文的數量在其自然科學論文總產出中所占的比例，自然指數年度榜單還首次推出經過歸一化計算的大學科研機構榜單。經過歸一化計算排名全球前三位的大學研究機構為：美國冷泉港實驗室、奧地利科技學院和以色列魏茨曼科學研究院。南京大學、香港科技大學、山東師范大學、南開大學和南方科技大學則是按照歸一化計算方法中國排名最前列的大學研究機構。

自然指數創始人戴維·斯溫班克斯（David Swinbanks）表示：“今年隨標準的自然指數年度榜單一起發布了經過歸一化計算的排名，這尤其引人關注，因為這個排名讓人們看到一些規模較小的機構在產出比例方面超過了強大的研究機構，從而不被埋沒于標準榜單的底部。”