【摘要】
全世界生物醫(yī)學(xué)界和教科書(shū)都公認(rèn)G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)需要七重跨膜區(qū)才能起到信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的功能。這一公認(rèn)幾十年未改變,即使裴鋼-凌堃在1999年就發(fā)表論文號(hào)稱只要五重跨膜就足夠有幾乎完整的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)功能。
2001年4月1日,凌堃提交給中國(guó)科學(xué)院大學(xué)被批準(zhǔn)獲得博士學(xué)位的論文,更是號(hào)稱只要一重跨膜就可以。
這些結(jié)果從來(lái)沒(méi)有幾個(gè)人相信。
2021年7月6日,中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所四個(gè)課題組合作發(fā)表論文,實(shí)際提供了直接證據(jù),否定了裴-凌的結(jié)論。他們發(fā)現(xiàn)只要突變單個(gè)氨基酸,GPCR就大大失去信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的能力。其中三個(gè)氨基酸就在裴-凌去除的大片段之中。
除了這篇公開(kāi)發(fā)表的論文之外,中國(guó)還有科學(xué)家直接按照裴-凌原文直接去除同樣的大片段,發(fā)現(xiàn)裴-凌的五重跨膜蛋白更是沒(méi)有信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)功能。這一結(jié)果也有人寄給饒毅了,也提交給法院了,在此一并公布。
凡是繼續(xù)相信裴-凌的生物學(xué)研究人員,可以實(shí)名聯(lián)系饒毅,獲得中國(guó)某實(shí)驗(yàn)室制備的DNA,自己親自驗(yàn)證裴-凌結(jié)果到底能不能被重復(fù)。有結(jié)果或高明的想法,應(yīng)該與關(guān)心科學(xué)真理的人共享,而不是幾個(gè)人在暗處秘商對(duì)付人、卻不應(yīng)對(duì)科學(xué)實(shí)驗(yàn)結(jié)果。這種行為不是現(xiàn)代科學(xué)界的正常行為。
本文分七重進(jìn)行敘述。
【一 裴鋼-凌堃論文明辨是非的意義】
當(dāng)論文涉及無(wú)關(guān)緊要的事情,是否應(yīng)該搞清楚,不同的人會(huì)有不同意見(jiàn)。
當(dāng)論文涉及重大科學(xué)概念的時(shí)候,任何嚴(yán)肅的科研工作者(不需要是達(dá)到科學(xué)家程度的科研工作者)都會(huì)認(rèn)為應(yīng)該搞清楚。
科學(xué)畢竟不是兒戲,不能隨隨便便。
裴鋼-凌堃于1999年在《美國(guó)科學(xué)院院刊》發(fā)表論文,聲稱G蛋白偶聯(lián)受體(GPCR)不用正常的七重跨膜,而只有五重跨膜就可以。
裴鋼-凌堃的論文要么錯(cuò)了,要么是重大突破。
GPCR是包括中國(guó)在內(nèi)的全世界生物學(xué)和醫(yī)學(xué)本科生和研究生都必修的內(nèi)容。如果因?yàn)橹袊?guó)一篇奇特的論文,只有中國(guó)有些老師教學(xué)生其他科學(xué)家不相信的結(jié)果,就會(huì)引起問(wèn)題:是堅(jiān)持真理,還是堅(jiān)持謬誤?
【二 上海藥物所GPCR結(jié)構(gòu)專家的最新論文】
中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所,來(lái)源于二戰(zhàn)前的北平藥物研究所,長(zhǎng)期是中國(guó)最優(yōu)秀的藥物研究所,我曾經(jīng)兩次介紹其歷史上的優(yōu)秀研究成果。
雖然近年上海藥物所在某方面被很多人認(rèn)為有重大失誤(不排除某些所領(lǐng)導(dǎo)人的嚴(yán)重失職),但它目前是中國(guó)研究GPCR結(jié)構(gòu)的最好的單位之一。
2021年7月6日,屬于中國(guó)科學(xué)院上海藥物研究所、國(guó)家藥物研究重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、上海科技大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院(簡(jiǎn)稱“上海藥物所”)的研究人員,四個(gè)課題組合作在《自然 通訊》上發(fā)表論文,解析了一個(gè)GPCR的結(jié)構(gòu)。
這個(gè)GPCR是CCR5,正是裴鋼-凌堃研究的兩個(gè)受體之一。數(shù)年前國(guó)外研究過(guò)這一受體的結(jié)構(gòu),但上海藥物所的結(jié)構(gòu)生物學(xué)專家解析了CCR5與其自然配體(RANTES)結(jié)合的復(fù)合體結(jié)構(gòu)。
上海藥物所的論文,提供的證據(jù),可以直接否定裴鋼-凌堃的論文。
裴鋼-凌堃用的簡(jiǎn)稱五重跨膜的CCR5,實(shí)際缺失了第一、第二跨膜區(qū)外還缺失了第三跨膜區(qū)的幾個(gè)氨基酸,缺乏了從第36位到第107位共72個(gè)氨基酸的一大段序列。
裴鋼-凌堃的論文號(hào)稱,缺失這72個(gè)氨基酸之后,CCR5在其自然配體RANTES刺激下,可以幾乎與七重跨膜一樣的(接近百分之百地)將信號(hào)從細(xì)胞膜外轉(zhuǎn)導(dǎo)到細(xì)胞膜內(nèi)(裴鋼-凌堃的結(jié)果見(jiàn)她們論文的第3、4、5圖)。
下圖為裴鋼-凌堃圖1的截屏,這里補(bǔ)充了紅色標(biāo)注,顯示上海藥物所突變的單個(gè)氨基酸的部位(Y37、W86、T105):
上海藥物所的論文首先顯示配體與CCR5的結(jié)合位點(diǎn)包括裴鋼-凌堃所去除區(qū)域的氨基酸(如47、83、86、105)。這些結(jié)果的推論是,因?yàn)榕潴w與CCR5受體結(jié)合需要這些位點(diǎn),如果失去它們而不能結(jié)合,自然就談不上轉(zhuǎn)導(dǎo)信號(hào)。
(藥物所論文第3頁(yè):配體RANTES結(jié)合CCR5受體的多個(gè)跨膜區(qū),包括第一、第二和第三跨膜區(qū);
藥物所論文第5頁(yè):配體RANTES結(jié)合第二跨膜區(qū)的第86位氨基酸、第三跨膜區(qū)的第105位氨基酸;
藥物所論文第6頁(yè):配體RANTES的特定氨基酸Y3結(jié)合CCR5的第37位、第83位、第86位氨基酸)。
上海藥物所還發(fā)表結(jié)果,直接顯示去除第37位、第86位或第105位的任何一個(gè)氨基酸,都大大降低信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo),這一結(jié)果的文字?jǐn)⑹鲈谒幬锼撐牡?頁(yè),數(shù)據(jù)顯示在藥物所論文附圖8c。
而裴鋼-凌堃號(hào)稱去除含這三個(gè)氨基酸的大片段(72個(gè)氨基酸)之后,信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)幾乎百分之百如正常(裴鋼-凌堃有關(guān)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的結(jié)果見(jiàn)其論文的圖3、4、5)。
這些結(jié)果直接表明,缺乏這些氨基酸之一就難以轉(zhuǎn)導(dǎo)信號(hào),如果缺乏大段,那么就更沒(méi)有信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)的可能性,也就是說(shuō)裴鋼-凌堃的結(jié)果不可能是對(duì)的。
【三 以細(xì)節(jié)捍衛(wèi)裴鋼-凌堃之路已被鐵的事實(shí)所阻斷】
不排除有人會(huì)繼續(xù)為裴鋼-凌堃辯護(hù)(甚至出現(xiàn)某些作者懼怕裴鋼而不敢嚴(yán)守真理),扭曲地辯論:去掉大片段,不一定比去掉單個(gè)位點(diǎn)的表現(xiàn)更差。
可惜,這種辯護(hù)也被事實(shí)所否定。中國(guó)已經(jīng)有實(shí)驗(yàn)室制備與裴鋼-凌堃一樣的大片段缺失的CCR5(同樣去除第36至第107位的72個(gè)氨基酸),也就是裴-凌的五重跨膜CCR5,而且證明這樣的五重跨膜CCR5受體毫無(wú)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)作用。
他們通過(guò)共同認(rèn)識(shí)的中間科學(xué)家,把結(jié)果給我了,下圖是他們結(jié)果的截屏(圖上半部分七重跨膜的CCR5在配體RANTES刺激下可以轉(zhuǎn)導(dǎo)信號(hào),圖中下半部分顯示五重跨膜的CCR5不能):
【四 凌獲得博士、裴為導(dǎo)師的論文中一重跨膜】
有趣的是,凌堃在2001年的4月1日提交自己的博士論文。
論文的研究結(jié)果第一部分是其在美國(guó)發(fā)表的五重跨膜。
而博士論文還有石破天驚的第二部分結(jié)果:一重跨膜(單次跨膜)的受體信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)功能也基本百分之百類似與七重跨膜的受體。
如果有極少數(shù)生物學(xué)界十分糊涂或沒(méi)有良心的人敢于捍衛(wèi)五重跨膜,恐怕沒(méi)有一個(gè)學(xué)過(guò)生物的敢于捍衛(wèi)裴鋼指導(dǎo)的凌堃的博士論文中“一重跨膜”部分。
不能排除這樣的可能性:今天的裴鋼和凌堃,看到這篇批評(píng),都不敢出來(lái)捍衛(wèi)一重跨膜的結(jié)果。
事實(shí)證明,要裴鋼或凌堃公開(kāi)認(rèn)錯(cuò)是不太可能的。
但是,認(rèn)識(shí)他們的人,應(yīng)該私下問(wèn)他們。
特別是有幾個(gè)非常積極地在院士群體中散布所謂裴鋼-凌堃已經(jīng)被重復(fù)了的觀點(diǎn),他們就應(yīng)該問(wèn)裴鋼這個(gè)問(wèn)題:一重跨膜你還相信嗎?
估計(jì)曾經(jīng)支持裴鋼的張曙光,現(xiàn)在也不敢出來(lái)支持凌/裴所謂一重跨膜有信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)功能的結(jié)論。
這些積極支持裴鋼的人,應(yīng)該有所思考,然后決定自己是尊重科學(xué)、尊重事實(shí)、追求真理,還是小團(tuán)體的江湖第一、個(gè)人關(guān)系第一。
按我對(duì)不久前入選院士的裴鋼夫人馬蘭的理解,她就不可能相信一重跨膜。她要是公開(kāi)說(shuō)一重跨膜、五重跨膜都是對(duì)的,我可能就會(huì)驚訝的從此永遠(yuǎn)不再為此發(fā)聲。
繼續(xù)積極支持裴鋼的人,不應(yīng)該躲在暗處秘商怎么對(duì)付人,而應(yīng)該拿出事實(shí)、按照邏輯,公開(kāi)證據(jù)、以理服人。在科學(xué)的事實(shí)面前,不敢公開(kāi)而秘密寫(xiě)信的是違反科學(xué)基本規(guī)范。參與這種活動(dòng)的人應(yīng)該把自己改稱“中國(guó)江湖院生物醫(yī)學(xué)支”,以免牽連中國(guó)科學(xué)院數(shù)理化等絕大多數(shù)尊重科學(xué)的學(xué)科的人、和中國(guó)科學(xué)院生物醫(yī)學(xué)部尊重科學(xué)的那些科學(xué)家。
【五 請(qǐng)拿出事實(shí)、拿出實(shí)驗(yàn)證據(jù)】
最后,如果有人不信否定裴鋼-凌堃結(jié)果的證據(jù),甚至繼續(xù)捍衛(wèi)其不可重復(fù)的結(jié)果,歡迎他們自己制備同樣的DNA,重復(fù)比較五重跨膜與七重跨膜GPCR的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)功能。
因?yàn)槠渌麑?shí)驗(yàn)室給了我七重和五重跨膜CCR5(和CXCR4)的DNA,歡迎任何實(shí)名科學(xué)家、科研工作者從我這里獲取這些DNA。獲得后,請(qǐng)用DNA測(cè)序驗(yàn)證確實(shí)是缺乏36至107氨基酸的“五重跨膜”CCR5,然后可以自己親自或請(qǐng)實(shí)驗(yàn)室的學(xué)生重復(fù)裴鋼-凌堃的實(shí)驗(yàn),親眼見(jiàn)證裴鋼-凌堃實(shí)驗(yàn)結(jié)果的不可重復(fù)性。
如果不敢重復(fù)實(shí)驗(yàn),卻堅(jiān)持捍衛(wèi)自己的錯(cuò)誤、或不顧事實(shí)堅(jiān)持捍衛(wèi)其他人奇特的被反復(fù)證明的錯(cuò)誤,就很奇怪了。
科學(xué),難道不是依據(jù)事實(shí)、依賴可重復(fù)事實(shí)的嚴(yán)肅事情?
不會(huì)有人認(rèn)為科學(xué)是可以被人玩弄的兒戲吧?
在什么時(shí)間、地點(diǎn)、人群里面,科學(xué)是可以被任意改變結(jié)果的兒戲?
這是我們每一個(gè)科學(xué)工作者、每一個(gè)有良心的人,需要思考的問(wèn)題。
【六 論文引用】
裴鋼-凌堃論文:
Ling K, Wang P, Zhao J, Wu Y-L, Cheng Z-J, Wu, G-X, Hu W, Ma L and Pei G (1999) Five transmembrane domains appear sufficient for a G protein-coupled receptor: Functional five-transmembrane domain chemokine receptors. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 96:7922-7927.
上海藥物所論文:
Zhang H, Chen K, Tan Q, Shao Q, Han S, Zhang C, Yi C, Chu X, Zhu Y, Xu Y, Zhao Q and Wu B (2021) Structural basis for chemokine recognition and receptor activation of chemokine receptor CCR5. Nature Communication 12:4151.
【七 上海藥物所有關(guān)文字截屏】
第3頁(yè)
第5頁(yè)
第6頁(yè)
第6頁(yè)
附圖8c
附加:凌堃論文“一重跨膜”結(jié)果部分截屏
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