國家重點研發計劃由原來的973計劃、863計劃、國家科技支撐計劃、國際科技合作與交流專項、產業技術研究與開發基金和公益性行業科研專項等整合而成。國家重點研發計劃 ，針對事關國計民生的重大社會公益性研究，以及事關產業核心競爭力、整體自主創新能力和國家安全的重大科學技術問題，突破國民經濟和社會發展主要領域的技術瓶頸。

作為反映高校科研水平的重要指標，國家重點研發計劃重點專項立項數量及經費情況直接反映了大學在頂尖領域的真實水平。國家重點研發計劃自2016年開始設立，至今3年多時間內國內高校收獲頗豐。

在2016-2018年度的國家重點研發計劃立項中，清華大學獲得的中央財政經費是高校系統中最多的，三年累計經費已達21.93億元；其次是北京大學，三年累計經費為14.17億元；排在第三位的是浙江大學，三年累計經費為11.96億元。獲得國家重點研發計劃經費支持最多的非“雙一流”建設高校是首都醫科大學，三年累計經費為4.96億元。獲得2016-2018年度國家重點研發計劃經費支持最多的TOP100高校如下：

2016-2018年度國家重點研發計劃經費支持最多的TOP100高校

（注：附屬單位獲批項目已劃歸到本單位，其中中日友好醫院歸屬到首都醫科大學）